Die Akkus der Mini 3 Pro und Mini 4 Pro sind nicht kompatibel mit der Mini 5 Pro. Die Mini 3 Akkus funktionieren mit der Mini 4 Pro, aber nicht umgekehrt, und für die Mini 5 Pro werden eigene intelligente Flugakkus verwendet, die nicht mit den Vorgängermodellen kompatibel sind. Zudem kann die Verwendung von Mini 4 Pro Akkus in der Mini 5 Pro das Gewicht erhöhen und die Drohne in eine andere Gewichtsklasse (C1 statt C0) bringen.