Als Link word je wakker in een vreemd land, ver weg van Hyrule, waar dieren praten en monsters rondzwerven. Om de waarheid over je verblijfplaats te onthullen en de legendarische Windvis te wekken, verken je Koholint-eiland en al zijn met vallen bezaaide kerkers, die voor deze heruitgave van een van de populairste The Legend of Zelda-spellen met adembenemende details opnieuw zijn geïnterpreteerd. Onderweg ontmoet je een hilarische selectie van betoverende personages van wie je nooit meer afscheid wilt nemen.

In deze nieuwe versie van het spel is de klassieke soundtrack herboren met nieuwe arrangementen, en nu kun je meer voorwerpen tegelijk uitrusten, belangrijke gesprekken volgen en op nieuwe manieren op de kaart navigeren. Probeer de gerenoveerde minigames uit om poppen te verdienen op basis van de Super Mario-serie of Kamerstenen. Met deze ongebruikelijke stenen kun je je eigen kamerkerkers inrichten. Elk van hen is een puzzel op zich! Plaats kamers uit kerkers die je gedurende het spel vindt op een reeks doelgerichte raster. Waar moeten de bazen heen? Hoe kom je van de ingang naar de trap? Het zijn jouw kerkers, dus rangschik ze zoals jij het goed acht. Om meer kamerstenen te verdienen, moet je de kerkers en minigames van het hoofdavontuur overwinnen of op een willekeurige Amiibo met een "The Legend of Zelda"-personage tikken om kamers vrij te spelen die alleen via amiibo beschikbaar zijn.